武漢大學基礎醫學院源于湖北省立醫學院基礎部，創始人為知名醫學專家、留德醫學博士朱裕璧教授。經過七十年的歷程，學院已發展成為集教學、科研和社會服務于一體的國家基礎醫學人才培養和科學研究基地。

學院共有9個系（人體解剖學與組織胚胎學系、生理學系、病原生物學系、藥理學系、免疫學系、病理與病理生理學系、生物化學與分子生物學系、醫學遺傳學系、生物醫學工程系），1個研究所（武漢大學醫學病毒學研究所），3個中心（武漢大學醫學結構生物學研究中心、武漢大學基礎醫學實驗教學中心、武漢大學食品與藥品安全評價研究中心）。現有教職工210余人，其中教授39人、副教授59人、博士生導師48人，現有國家“萬人計劃”領軍人才1人，科技部中青年科技創新領軍人才1人，國家杰出青年基金獲得者2人、“新世紀百千萬人才工程”1人、國家高水平人才9人、國務院政府特殊津貼5人、教育部新世紀人才4人、湖北省高端人才計劃重點培養對象1人、湖北省“醫學領軍人才”1人、湖北省其他高水平人才6人、湖北省創新團隊3個、湖北省杰出青年基金獲得者5人、珞珈杰出學者1人、珞珈學者特聘教授3人、珞珈青年學者7人。

學院擁有基礎醫學一級學科博士學位授予權、基礎醫學博士后流動站、國家“985工程”和“211工程”重點建設項目、2個省級重點學科（基礎醫學一級、藥理學二級），1門國家級雙語教學示范課程（醫學免疫學），1個國家級教學團隊（醫學機能實驗學教學團隊），2門國家級來華留學英語授課品牌課程（局部解剖學、醫學免疫學），5門省級精品課程（藥理學、人體解剖學、病理生理學、人體寄生蟲學和醫學免疫學），1個省級實驗教學示范中心，2個省級重點實驗室（過敏及免疫相關疾病湖北省重點實驗室、發育源性疾病湖北省重點實驗室）。學院病原生物學系和免疫學系為武漢大學病毒學國家重點實驗室的重要組成部分。近年來獲衛生部全國優秀教材一等獎1項，主編國家級“十二五”規劃教材1部。

經教育部審批，學院獲批增設基礎醫學新專業。學院承擔著臨床醫學、口腔醫學、護理學、醫學檢驗學和預防醫學5個專業的四、五年制本科生、七年制本碩連讀生和八年制本碩博連讀生（臨床醫學和口腔醫學）以及碩士生、博士生的醫學基礎課教學任務。幾十年來，已培養了醫學本科生20000余名，博士、碩士生3000余名，為國家醫療衛生、教育、科學事業作出了重要的貢獻。現有本科生1500余人，碩士生120余人，博士生110余人，留學生300余人。我院學生曾獲得全國大學生英語競賽特等獎、全國大學生“挑戰杯”創業計劃大賽金獎、中國大學生“自強之星”、湖北省大學生演講比賽特等獎、湖北省大學生優秀科研成果獎、武漢大學英語演講比賽第一名等表彰，學生參與的“青春紅絲帶”活動獲團中央“優秀社會實踐隊”稱號。

近5年學院獲批國家自然科學基金項目96項，其中杰出青年基金2項、重點項目2項、重大國際合作1項、國家重大專項2項、“973”項目1項、課題2項，發表SCI論文200余篇，授權發明專利37項，獲國家科技進步獎二等獎2項、省自然科學二等獎2項、三等獎2項、中華醫學獎二等獎2項。

學院積極實施開放辦學的戰略思想，與美國、英國、日本、芬蘭等20多個國家及地區的一些院校建立了院（校）際交流關系。開設了與法國南錫大學聯合培養的臨床醫學七年制、八年制中法實驗班，與美國芝加哥大學合作的臨床醫學五年制實驗班。

學院已成為培養高素質的、具有創新意識的優秀醫學專業人才的搖籃。武漢大學人民醫院、中南醫院和口腔醫院三所國家三級甲等醫院為學院所有醫學生的早期接觸臨床教育基地。

學院曾多次被評為湖北省衛生系統先進集體、省先進基層黨組織和全省高校大學生思想政治教育工作先進基層單位。