建筑工程學院的前身主要是原江西工學院的土木建筑工程系，辦學始于1940年創建的國立中正大學土木水利學科。自1958年創系后，于當年招收了第一屆工業與民用建筑專業學生，次年建筑學專業開始招生，以后經歷過專業下馬、師生下放等變動，全系師生曾輾轉萍鄉、武寧、景德鎮等地，辦學實力大受損傷。學校恢復招生后，土木建筑工程系于1970年招收了水利水電專業學生，1972年恢復了工民建專業，1981年恢復了建筑學專業，1985年學校更名為江西工業大學后，系里又于1987年增設了給水排水專業。1993年南昌大學成立后，在原土木建筑工程系的基礎上，分別組建了土木工程系、建筑系、水利電力工程系和工程力學研究所。學校為了適應擴并后管理的需要，推行了校、院、系（所）三級管理制，由此，建筑與環境工程學院得以成立，2003年更名為建筑工程學院。

學院現有建筑、土木工程、水利工程、工程力學4個系，下設設計基礎、建筑設計、建筑技術與理論、城市規劃、美術、工程結構、巖土與地下工程、工程管理、道橋工程、給排水科學與工程、建筑節能、水工、水資源與水信息、遙感與測繪、工程力學15個教研室，開設建筑學、城鄉規劃、土木工程、給排水科學與工程、工程管理、建筑環境與能源應用、水利水電工程、工程力學等8個本科專業，其中建筑學和土木工程為江西省品牌專業，土木工程為江西省特色專業，土木工程（道路與橋梁方向）列為國家級卓越工程師計劃，土木工程和建筑學已通過住房和城鄉建設部專業評估（認證）。學院擁有力學博士后流動站，力學一級學科博士點，力學、土木工程、水利工程和建筑學4個一級學科碩士點，建筑與土木工程、水利工程2個專業碩士領域。