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山西醫科大學的前身是山西醫學傳習所,1919年創建于古城并州。1932年改為私立山西川至醫學專科學校。1940年更名為山西大學醫學專修科。1946年升格為國立山西大學醫學院。新中國成立后，學校步入嶄新的發展時期。1953年獨立建校，更名為山西醫學院。1996年更名為山西醫科大學。

學校是全國第三批、山西省首批博士學位授權單位，全國首批碩士學位授權單位，全國首批學士學位授權單位，教育部首批“卓越醫生教育培養計劃”試點單位，全國首批恢復兒科學本科專業的8所醫學院校之一，國家中西部高校基礎能力建設工程支持高校，高水平公共衛生學院建設高校，國家級創新創業學院建設單位。

經過104年的建設發展，學校已成為一所以醫學為主，醫工結合、醫理結合、醫文結合、醫管結合，協調發展的醫科大學，擁有以本科教育為主、本碩博多層次的完整人才培養體系，形成了“醫理博精、德能高邃”校訓、“獻身、務實、團結、進取”校風和“求實精進、堅韌弘毅”的山醫精神。

學校現有川至、迎澤、中都三個校區，占地總面積1422畝，建筑面積71萬平方米。現有第一臨床醫學院、第二臨床醫學院、第三臨床醫學院、第五臨床醫學院、基礎醫學院、公共衛生學院、藥學院、法醫學院、護理學院等33個教學機構，第一醫院、第二醫院、第三醫院、第五醫院、口腔醫院、精神衛生醫院、肺科醫院等15所直屬附屬醫院，49個教學醫院，125個其它教學基地，15個研究生培養基地，2個科學研究基地。

學校現有教職醫護員工7000余人，研究生導師2000余人，臨床教師2200余人。擁有國家杰出青年科學基金獲得者、優秀青年基金獲得者、國家“萬人計劃”領軍專家、國家重點研發計劃首席科學家、享受政府特殊津貼人員、國家級有突出貢獻專家、中央聯系的高級專家、“新世紀百千萬人才工程”國家級人選、教育部新世紀優秀人才、教育部教學指導委員會委員、國家級教學名師、中華醫學會專科分會主任委員等國家、省部級專家及高層次人才430余人，國家優秀教學團隊等國家、省級教學團隊24個。

學校現有1個國家重點學科——生理學；2個教育部重點實驗室——細胞生理學實驗室、煤炭環境致病與防治重點實驗室；1個省部共建協同創新中心——分子影像精準診療協同創新中心；1個國家衛生健康委重點實驗室——塵肺病重點實驗室；3個國家級示范中心——臨床技能實訓中心、基礎醫學實驗教學中心、臨床教學培訓示范中心；21個國家臨床重點專科——重癥醫學、泌尿外科學、中醫護理學、骨科學、腎病學、普通外科學、老年病學、急診醫學、風濕免疫學、護理學、病理學、眼科學、心血管內科、神經外科，呼吸內科；各類省級優勢、特色、重點學科15個；各類省級重點教學科研平臺59個。現有4個一級學科設有博士后科研流動站——臨床醫學、公共衛生與預防醫學、特種醫學、生物學。6個一級學科博士學位授權點——特種醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、基礎醫學、護理學、藥學；2個博士專業學位授權點——臨床醫學、口腔醫學；10個一級學科碩士學位授權點——特種醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、基礎醫學、口腔醫學、護理學、藥學、醫學技術、馬克思主義理論、心理學；8個碩士專業學位授權點——臨床醫學、口腔醫學、公共衛生、護理、藥學、應用心理、社會工作、圖書情報。

學校現有12個國家一流本科專業建設點——臨床醫學、預防醫學、法醫學、藥學、護理學、麻醉學、口腔醫學、醫學檢驗技術、兒科學、基礎醫學、臨床藥學、衛生檢驗與檢疫。5個國家級特色專業建設點。臨床醫學（五年制）、臨床醫學（農村定向免費生）、護理專業為教育部首批國家“本科教學工程”地方高校本科專業綜合改革試點專業。學校設有臨床醫學（五年制、“5+3”一體化）、預防醫學、法醫學、口腔醫學、兒科學、醫學影像學、麻醉學、護理學、精神醫學、眼視光醫學、藥學等32個本科專業。