上海財經大學的經濟學教學與研究歷史源遠流長。早在上世紀30年代由著名經濟學家馬寅初擔任國立上海商學院教務長時，就設立了經濟研究室。1950年8月，上海法學院財經系科并入，學院增設經濟系。1951年6月，經濟系更名為經濟計劃系。1958年8月，經濟計劃系隨學校與華東政法學院合并成立上海社會科學院。1960年重建上海財經學院，設商業經濟等專業；1962年夏，撤商業經濟專業，設工業經濟、貿易經濟等專業，直到1972年4月隨學校被撤銷。1978年復校，1980年2月成立經濟學系，由原經濟學系、數量經濟研究所合并組成。2000年4月成立經濟學院。

新中國上海財政經濟學院首任院長孫冶方，老一輩經濟學家姚耐、孫華承、王惟中、楊銀溥、胡寄窗，經濟學系首任系主任張淑智，經濟學院歷任院長程恩富、胡景北等為經濟學院的發展奠定了堅實的基礎。現任院長為教授周亞虹。

近年來，經濟學院秉持“中國特色、世界一流、國家急需、服務社會”的發展方略，以“經濟學創新平臺”建設項目為載體，圍繞“聚一流教師、匯一流學生、設一流課程、育一流人才、做一流研究、臻一流治理、創一流學科、建一流學院”的八個一流方針，全面開啟了具有歷史意義的體制內經濟學教育科研改革，其宗旨就在于立足中國國情和學校實際，參照國際一流研究型大學先進的辦學理念和成熟的管理規范，實踐教育科研改革，系統地建立一整套長效機制，致力于培養厚德博學的具有深厚文化素養、扎實經濟學理論功底、高效生產力、開放國際視野的高素質創新型人才，打造國內頂尖、世界一流的有影響力的經濟學院。

為此，經濟學院圍繞“打造一流師資、強化學術研究、深化教學改革、狠抓學風教風、嚴化教師考核、規范行政管理”等六項工作實施了全方位、多層次、高起點的改革，構建起適應經濟學教育科研改革與發展需要的機制框架。與此同時，學院高度重視改善教師的教學科研工作環境，堅持科學發展，構建和諧學院。學院通過推行助教助研制度、提供科研資助經費，以及建設現代化的教學科研一體化辦公大樓等一系列措施，大力改善了教師和學生的工作學習環境。

隨著改革的不斷深入和成效的不斷顯現，經濟學院這種具有鮮明特色的經濟學教育科研改革產生了巨大的影響效應、凝聚效應、示范效應和帶動效應，引起國內外教育界的廣泛關注。作為教育部、財政部、國務院學位辦聯合立項的國家重點教育改革專門項目，“經濟學創新平臺”項目得到教育部、財政部專項資金以及上海市配套資金的大力支持。2006年底，“經濟學創新平臺”又被列入國家首批985“優勢學科創新平臺項目”。2015年，理論經濟學學科成功入選上海市高峰學科（Ⅱ類）。從資金和政策上為學科建設提供了保障，從而為經濟學院教育科研改革與發展的可持續性奠定了堅實基礎。

目前，經濟學院下設政治經濟學系、經濟史學系、經濟學系、數量經濟學系、經濟思想史和經濟史研究中心、數量經濟研究所、亞洲經濟研究所、制度經濟研究所和勞動經濟研究所等教學研究單位，擁有理論經濟學一級學科博士學位授予權和博士后流動站，設有政治經濟學、經濟思想史、經濟史、西方經濟學、數量經濟學、人口資源與環境經濟學、勞動經濟學等七個學術型專業點和金融專業碩士（金融計量經濟學方向），以及涵蓋國家經濟學基礎人才培養基地班、數理經濟實驗班、數量經濟學、勞動經濟學、世界經濟學五個專業方向的經濟學本科專業。

截至2018年初，學院現有全職教研人員93人，其中國務院特殊津貼專家4人，國家百千萬人才工程1人，教育部新世紀優秀人才4人，上海市曙光學者2人。全職教師中，教授24人，副教授50人，教師中擁有海外博士學位的有60人，占比約64%。現有在冊學生1089名，本科生717名，研究生（含碩士生、碩博連讀生、博士生）372名。